办公室
集“后勤保障、人事档案管理、协助其他部门开展活动”三项基本职能于一体的综合性职能部门，主要负责撰写组织文件，评优评先，内部账目管理工作，与各大学生组织交流联系。为增进国旗护卫队内部的团结与交流起着桥梁枢纽作用。
宣传部
主要负责对国旗护卫队活动的宣传工作，协助国旗护卫队的各项工作。以手工绘画、网络平台等形式对国旗护卫队各项活动进行宣传报道，并努力进行网络平台建设，努力满足广大同学获取活动内容的需要，保证宣传工作的及时、生动，提高国旗护卫队的影响力。
组织部
主要负责组织开展国旗护卫队各项活动，协助其他部门完成工作。以策划活动形式和内容、组织全校师生共同开展系列活动为主要任务，对国旗护卫队日常活动、重要节日活动和与其他学生组织一起承办的活动的开展起到重要作用。
作训部
主要负责开展护旗队集中训练、学校日常升旗和重要节日、纪念日的升旗工作安排。在此基础上，作训部要以“铁的毅力，铁的信念，铁的纪律”为目标，严格对国旗护卫队队员进行训练，努力打造出一支优秀的国旗护卫队伍。
礼仪队
礼仪队原名为“安徽财经大学校礼仪队”，成立于2001年，于2014年9月被纳入国旗护卫队，现属于国旗护卫队下属部门。礼仪队是经过严格选拔而组建的一支朝气蓬勃的队伍，礼仪队队员经过专业的形体、礼仪、化妆、综合素质等课程的培训，学习礼仪知识，培养外在气质，树立礼仪规范，提供礼仪服务，在展现美和高雅的过程中，时刻“扬中华礼仪文化，传实事求是精神，展财大学子风采”。
集“后勤保障、人事档案管理、协助其他部门开展活动”三项基本职能于一体的综合性职能部门，主要负责撰写组织文件，评优评先，内部账目管理工作，与各大学生组织交流联系。为增进国旗护卫队内部的团结与交流起着桥梁枢纽作用。
宣传部
主要负责对国旗护卫队活动的宣传工作，协助国旗护卫队的各项工作。以手工绘画、网络平台等形式对国旗护卫队各项活动进行宣传报道，并努力进行网络平台建设，努力满足广大同学获取活动内容的需要，保证宣传工作的及时、生动，提高国旗护卫队的影响力。
组织部
主要负责组织开展国旗护卫队各项活动，协助其他部门完成工作。以策划活动形式和内容、组织全校师生共同开展系列活动为主要任务，对国旗护卫队日常活动、重要节日活动和与其他学生组织一起承办的活动的开展起到重要作用。
作训部
主要负责开展护旗队集中训练、学校日常升旗和重要节日、纪念日的升旗工作安排。在此基础上，作训部要以“铁的毅力，铁的信念，铁的纪律”为目标，严格对国旗护卫队队员进行训练，努力打造出一支优秀的国旗护卫队伍。
礼仪队
礼仪队原名为“安徽财经大学校礼仪队”，成立于2001年，于2014年9月被纳入国旗护卫队，现属于国旗护卫队下属部门。礼仪队是经过严格选拔而组建的一支朝气蓬勃的队伍，礼仪队队员经过专业的形体、礼仪、化妆、综合素质等课程的培训，学习礼仪知识，培养外在气质，树立礼仪规范，提供礼仪服务，在展现美和高雅的过程中，时刻“扬中华礼仪文化，传实事求是精神，展财大学子风采”。
