根据题意这是一个仓储合同，涨货是由于气候原因造成的，属于违约责任中一般免责事由也就是不可抗力造成的，可以部分或全部免除责任，但是仓库漏雨而造成的货物损毁是因为保管不善造成的，保管人应该就损害的部分承担损害赔偿责任，根据题目，应该是有490吨涨货后的棉籽，只交给客户485吨，还有5吨涨货但是损毁的棉籽，保管人需要就这5吨损毁的棉籽进行赔偿，个人看法

有偿保管合同的保管人对于保管物的毁损只有在没有一般过失或者故意的情况下才不承担陪练责任。据你所言，货物损失是由于仓库漏雨所致 而作为仓库管理人 保证仓库干燥 适宜存储应当是其合同范围的一般义务 你疏于对仓库的管理导致对方损失 自然应当赔偿。