每100集左右会有大主线，平时有穿插在日常的主线，动画原创不存在主线

《名侦探柯南》动画主线及其他重要剧情汇总
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搬运问题解决中心

这个可以自己判断，我就是这样的

直接百度柯南主线，都有的

我记得前面有一段叫什么 绯色的啥 和什么红与黑的碰撞吧 有连着二三十集剧情 那里才正式与FBI 宝安 还有黑暗组织碰面

爱奇艺上有个主线篇你可以搜搜

只看主线呀

我从600开始看

我都慢慢地一集一集看日常

《来自黑暗组织的女子》（128-131）[爱奇艺136-141] 神秘女人灰原哀登场。
《与黑暗组织的再会》（176-178）[爱奇艺190-192] 贝尔摩德登场。
《与黑暗组织的接触》（307-313，345）[爱奇艺332-338，371-375] 追踪Gin 琴酒。引出新人物赤井秀一。
《黑色冲击》（425，462-465）[爱奇艺459-463，502-505] 组织成员水无怜奈、基安蒂、科恩出场，引出新人物本堂瑛佑。
《红与黑的对撞》（491-504）[爱奇艺538-551] 水无怜奈和本堂瑛祐的身份揭晓。引出新人物 Bourbon 波本
《神秘列车篇》（699-704）[爱奇艺751-756] 各方人物的身份初步揭露。Bourbon是安室透。
《绯色篇》（779-783）[爱奇艺832-836] 安室透和冲矢昴的身份以及赤井秀一的生死之谜彻底揭晓。引出新人物 Rum 朗姆