1、首先要检查超声波清洗纯水系统上所有的开关是否均处于关闭状态，再将石英砂过滤器设置成开启状态。
2、打开原水箱进水阀和石英砂过滤器出水阀。
3、打开活性炭过滤器进、出水阀。
4、打开精密过滤器进、出水阀。
5、观察预处理单元中的水达到高压泵时压力表的压力，若超过0.5kg/㎝2，就需开启反渗透后排空阀、浓水阀和溶水法。
6、开启高压泵，并缓慢开启高压泵后的出水球阀，关闭排空阀、淡水调节阀和浓水阀。
7、设定淡水河浓水流量，此时出水进入淡水箱。
8、开启淡水泵进出水阀和淡水泵。
9、打开混合离子交换器前级水阀、上进阀、出水阀，并调节上进阀，控制出水流量，同时观察电导率仪，若电导率小于2μs/㎝，说明水质合格，可进入纯化水箱，否则就排出。
10、打开紫外线杀菌器，对水质进行杀菌后输送至使用点。