题目:结合自己的研究领域中的一种疾病,比如肿瘤,神经退行性疾病、心血管疾病、精神性疾病、代谢疾病以及其它疾病进行识别疾病发展过程中的关键基因或蛋白或通路的研究,或其他采用生物信息学分析(副中文参考文献)。
(1)从GEO下载基因芯片数据,也可以是基于TCGA数据,二代测序数据等,其他组学数据都可以。
结果包括:
①差异基因(选取前50个,)
②对前50个差异表达基因绘制热图或火山图,或其他可视化效果图。
4)使用DAVID或 webGestalt或其他Go和KEGG工具,对差异表达基因进行富集和通路分析。
5)对差异基因进行PPI(蛋白-蛋白互相作用)分析。6)结合药物靶点进行相关分析(选做)生存分析(选做)
(1)从GEO下载基因芯片数据,也可以是基于TCGA数据,二代测序数据等,其他组学数据都可以。
结果包括:
①差异基因(选取前50个,)
②对前50个差异表达基因绘制热图或火山图,或其他可视化效果图。
4)使用DAVID或 webGestalt或其他Go和KEGG工具,对差异表达基因进行富集和通路分析。
5)对差异基因进行PPI(蛋白-蛋白互相作用)分析。6)结合药物靶点进行相关分析(选做)生存分析(选做)
