对于主角苏醒于白教区的深处，我认为是由于她并非之前批量克隆的产物，而是法隆在发现石板准备修复宝具期间，特意克隆，为测试甚至是修复宝具准备的（推测宝具修复需要白巫女的力量）。
证据1：主角苏醒于培养皿中，这说明她在灾变发生时仍未成熟，而其他小白巫女已经活跃了很久。
证据2：白教区的莉莉见过培养皿中的主角不止一次，这可以从莉莉留下的字条看出，语气十分熟络，大概率主角从开始诞生就是在白教区深处，而非地下。
继续说明。
证据3：从法隆的笔记可以得知，后期法隆与国王已经离心离德，转而偷偷进行拯救白巫女的研究，而白教很显然与国王不是穿一条裤子。因此可以合理推断，西莉亚字条2提及的“守护者之长与魔法师合谋研究白巫女”，其成果很可能就是位于白教区密室的主角和宝具修复装置。因为事端机密，西莉亚产生误解。
结合以上，法隆笔记提到的没有时间修复，并不是仅仅说他没有时间解读石板，个人认为没有解读的话，也不会有修复装置和主角的存在。由于修复需要白巫女的力量，泉妈把其他小白巫女藏起来了，法隆无从得知，也不敢在国王的监视下把禁区的小白巫女带走，于是决定重新克隆一位。但他受到了污秽侵蚀，时日无多，不能等待主角的醒来，去完成宝具。
大胆推测，法隆可能知晓费林的存在，甚至费林受法隆所托也不是完全不可能。从净化法隆时候，费林的发言，感觉对这个人有一定的了解。
从另一个角度讲，宝具是古代巫师的造物，费林不是巫师，他会解读石板，大概率是有人教的，比如法隆。
法隆下了好大一盘棋。