通常情况下，如果学生在期末考试中缺考并参加了补考，通过后是否会影响申请学位证书会因学校的具体规定而异。因此，建议您向所在学校或学院的学生事务部门咨询相关政策以获取准确信息。一般来说，对于大多数高校来说，只有当学生存在多次挂科或者严重违规行为时才会影响其申请学士学位的资格。而在正常完成课程学习、参加并通过了期末考试的条件下未能获得相应学分的情况，通常可以通过补考等方式进行弥补。在满足其他条件的情况下，一般仍然可以申请相应的学位证。但是具体的政策和要求可能因不同的学校和专业而有所不同，所以最好还是直接联系您所在的学校来了解详细情况。
