尖锐湿疣容易复发的原因有多种，主要原因为细胞免疫功能异常、尖锐湿疣亚临床感染，还可能为雌激素水平较高等。
1、细胞免疫功能异常：免疫系统缺陷患者，特别是细胞免疫功能异常者，更容易感染人乳头瘤病毒，导致尖锐湿疣发病率明显上升。
2、尖锐湿疣亚临床感染：人乳头瘤病毒潜伏感染可能导致非皮损区出现新临床和亚临床皮损，激光或冷冻治疗局部去除疣体后，人乳头瘤病毒感染细胞可能修复创面过程，导致原有皮损区再发生新皮损。
3、雌激素水平较高：雌激素受体在妊娠期尖锐湿疣组织中数目与强度都较高，可能与尖锐湿疣在妊娠期容易复发有关。
为减少尖锐湿疣的复发，需要针对上述原因采取相应治疗措施，如提高患者免疫功能、避免亚临床感染、降低雌激素水平等，同时定期复查和随访也是预防尖锐湿疣复发的关键。