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仁王3剧情就是竹千代（德川家光）穿越剧，BOSS是天草和葡萄人
根据仁王2结尾的年代，再过十几年就要岛原之乱了，再加上主角是家光，那必然会和岛原之乱扯上关系。
葡萄牙切支丹们为了灵石而怂恿天草四郎叛乱，因为灵石已被家康禁绝，所以天草打算穿越到战国时代收集灵石，且为了报复德川而打算改变历史，提前杀死战国时代的家康阻止德川统一日本，所以计划在各个关键时间点上阻击德川，比如三方原，所以这次应该会在各个时间点上跳跃，武田只是章节BOSS。
阿秀、猫又（或者还有威廉和其儿子，虽然岛原之乱时威廉应该过世，但有瑟夏在，活就是了）受幕府所托前去刺杀天草，结果被天草薄纱打残，阿秀濒死又要去中阴之间躺一会了，有除妖天赋的主角竹千代（毕竟家光养母是阿福，肯定会阴阳术，还能像赖光那样使用妖怪技）让阿秀把楚叶矢丸托付给自己，打算自己穿越回去救爷爷。
历经千险总算在过去打败了天草，终章再穿越回来和阿秀威廉一起联手干掉最终形态的妖怪天草，并赶跑葡萄牙人，最后途中顺带解决下主角家光的身世问题，还有GAYGAY的问题来给本作增添LGBT元素