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把科学和宗教信仰（这里指基督教）对立 起来，以科学来否定神 的存在，其实只是一种误解，或者说，是对科学的一种迷信。
道理很简单：所谓“科学”，其研究对象和手段都是物质的，除去物质之外，科学将一无所能。但 神并不是物质，而是造物之主，是超乎物质之上的，因此也就超越了科学研究的范畴，所以 任何科学都不具备对 神本身进行研究的有效手段。
一切科学研究都必须有与其目的相适应的手段，否则，必将一事无成。你要研究宏观的宇宙，就必须有足够强大的望远镜（光学的或射电的）；你要研究物体的微观结构或微生物，就必须有高倍显微镜（光学的，电子的乃至电子扫描的）；你要研究心血管功能，就必须有听诊器、血压计、心电图、超声扫描、光纤 内镜、Ｘ光机及其他各种必要的设备。如此等等。
那么，试问科学家们将用何种方法，何种手段去研究 神呢？
迄今为止，对于生命的奥秘，以及人体本身的各种奇妙现象，科学尚且不能作出满意的解答，更不必说去研究 神了。由于“神 的存在”这个命题显然超乎科学研究的范畴，至今世界上也没有任何一门科学是以研究神为目的，所以这个问题在科学上是无解的 。
换句话说，科学既不能直接证明有神，更不能证明无神。
因此，在这个科学完全无能为力的问题上，硬说科学否定了神的存在，这种说法本身就是武断的，不科学的。持此类论点者 ，大多是人云亦云，以为时尚；出于思熟虑者十中不得其一。如果你认真向他们请教：“究竟是那一门科学、又是怎样否定了神 的存在？”多数人常茫然不知所对。有些人勉强作答，也往往以偏概全，难以言之成理。
道理很简单：所谓“科学”，其研究对象和手段都是物质的，除去物质之外，科学将一无所能。但 神并不是物质，而是造物之主，是超乎物质之上的，因此也就超越了科学研究的范畴，所以 任何科学都不具备对 神本身进行研究的有效手段。
一切科学研究都必须有与其目的相适应的手段，否则，必将一事无成。你要研究宏观的宇宙，就必须有足够强大的望远镜（光学的或射电的）；你要研究物体的微观结构或微生物，就必须有高倍显微镜（光学的，电子的乃至电子扫描的）；你要研究心血管功能，就必须有听诊器、血压计、心电图、超声扫描、光纤 内镜、Ｘ光机及其他各种必要的设备。如此等等。
那么，试问科学家们将用何种方法，何种手段去研究 神呢？
迄今为止，对于生命的奥秘，以及人体本身的各种奇妙现象，科学尚且不能作出满意的解答，更不必说去研究 神了。由于“神 的存在”这个命题显然超乎科学研究的范畴，至今世界上也没有任何一门科学是以研究神为目的，所以这个问题在科学上是无解的 。
换句话说，科学既不能直接证明有神，更不能证明无神。
因此，在这个科学完全无能为力的问题上，硬说科学否定了神的存在，这种说法本身就是武断的，不科学的。持此类论点者 ，大多是人云亦云，以为时尚；出于思熟虑者十中不得其一。如果你认真向他们请教：“究竟是那一门科学、又是怎样否定了神 的存在？”多数人常茫然不知所对。有些人勉强作答，也往往以偏概全，难以言之成理。
有人问，是否因为他们（无神论者）看不到“有神”的具体证据才成做无神论者？他们回答说，“不是。”当然更不是因为他们另有能够证明“无神”的证据。
他们说，“无神论”的真正涵义只是“不相信有神” （Lack of belief in God），而不是“否定神的存在”（Denial of God's existence）。人们如果“相信”什么，那是需要证据的；但如果只是“不相信”，那就根本不需要证据。所以他们根本无须劳神去提供证据。这就是某些无神论者的辩词。
实际上这些人虽然不承认有神，他们也不能断定无神（否定神的存在），他们只是不相信而已。严格地说，他们只是“不信有神派”。
还有一派无神论者不像这一派这么圆滑，他们只是断然宣称，宇宙之中除物质之外别无所有，自然也就无所谓神灵。但怎样肯定这一点呢？那当然也是提不出任何证据的。说到头那也只不过是一种信念，一种类似宗教的，但却远不及宗教信仰更令人信服的哲学信念。
这类信念在哲学上属于自我否定（Self-defeating）的范畴。例如，有些人常说：“世界上没有绝对真理，一切都是相对的。”这个论点就是自我否定的。因为如果这个论点正确无误，那么它本身就成了绝对真理，因而也就否定了它自己。
唯物论也是如此。因为如果宇宙间果然除物质之外别无所有，那么人们的认识就不可能超出物质之外。因此，除物质之外，人们将一无所知，既然一无所知，你又怎能知道除物质之外别无所有？可见唯物论也是自我否定的。
凡是自我否定的论证都是不能成立的，所以唯物论也不能成立。“物”诚然存在，但“唯”字却没有根据。
他们说，“无神论”的真正涵义只是“不相信有神” （Lack of belief in God），而不是“否定神的存在”（Denial of God's existence）。人们如果“相信”什么，那是需要证据的；但如果只是“不相信”，那就根本不需要证据。所以他们根本无须劳神去提供证据。这就是某些无神论者的辩词。
实际上这些人虽然不承认有神，他们也不能断定无神（否定神的存在），他们只是不相信而已。严格地说，他们只是“不信有神派”。
还有一派无神论者不像这一派这么圆滑，他们只是断然宣称，宇宙之中除物质之外别无所有，自然也就无所谓神灵。但怎样肯定这一点呢？那当然也是提不出任何证据的。说到头那也只不过是一种信念，一种类似宗教的，但却远不及宗教信仰更令人信服的哲学信念。
这类信念在哲学上属于自我否定（Self-defeating）的范畴。例如，有些人常说：“世界上没有绝对真理，一切都是相对的。”这个论点就是自我否定的。因为如果这个论点正确无误，那么它本身就成了绝对真理，因而也就否定了它自己。
唯物论也是如此。因为如果宇宙间果然除物质之外别无所有，那么人们的认识就不可能超出物质之外。因此，除物质之外，人们将一无所知，既然一无所知，你又怎能知道除物质之外别无所有？可见唯物论也是自我否定的。
凡是自我否定的论证都是不能成立的，所以唯物论也不能成立。“物”诚然存在，但“唯”字却没有根据。
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有人说，宗教的产生乃是因为古时民智未开，人们尚不能正确理解自然现象，在面对诸如洪水、烈火、雷电、地震、山崩、海啸、火山、日蚀等剧烈现象时，不免心生恐惧，进而将这些现象人格化，以致产生神鬼的观念，然后逐渐发展为宗教信仰。所以说，神是人自己造出来的。现今由于科学昌明，人们已经彻底理解了这些现象的本质，自然也就消除了神鬼观念存在的基础。
这种说法只是现代无神论者的主观臆断，既不符历史事实，也缺乏现实根据，而且根本颠倒了因果。
很多人把本来不是神的东西（各种偶像，包括各种自然物象）当作神明来敬拜，那是对神的误认。其所以会有这种误认，显然是因为他们本来就有神的观念。
犹如人必须先有感觉，然后才有错觉，其理至明。只有失去母亲的孩子，才会把其他妇女错认为自己的母亲，其所以会错认，正是因为他心中本来有个母亲的影子。如果他自幼根本对母亲一无所知，就决不会有这种误认，更不会凭空造出一个母亲的形像。
猿猴及其他动物也会对雷电、地震等现象表现恐惧，但为什么却从不见它们有拜神的行为呢？原因很简单，因为它们根本没有神的观念。
人类则自古就有敬神的观念，这从古代人类遗物中很早就有各种祭器就可晓得。假如世间根本并无神灵存在，人是不可能凭空制造出神灵的观念的。
试想，如果外界根本没有光，人能有青红皂白、风景图画的观念吗？如果外界根本没有声音，人能有琴瑟钟鼓、语言音乐的观念吗？
我们知道，凡是寄生在动物体内的寄生虫类，或生活在地下暗河中的水生动物，都一概没有视觉，或根本没有眼睛，因为它们的生活环境中没有光。由此可知，如果世界上没有光和声，人甚至将根本不会有眼睛和耳朵，更不必说有关光和声的观念了。
同理，如果根本没有神灵存在，人类怎么能够凭空产生神灵的观念呢？
这种说法只是现代无神论者的主观臆断，既不符历史事实，也缺乏现实根据，而且根本颠倒了因果。
很多人把本来不是神的东西（各种偶像，包括各种自然物象）当作神明来敬拜，那是对神的误认。其所以会有这种误认，显然是因为他们本来就有神的观念。
犹如人必须先有感觉，然后才有错觉，其理至明。只有失去母亲的孩子，才会把其他妇女错认为自己的母亲，其所以会错认，正是因为他心中本来有个母亲的影子。如果他自幼根本对母亲一无所知，就决不会有这种误认，更不会凭空造出一个母亲的形像。
猿猴及其他动物也会对雷电、地震等现象表现恐惧，但为什么却从不见它们有拜神的行为呢？原因很简单，因为它们根本没有神的观念。
人类则自古就有敬神的观念，这从古代人类遗物中很早就有各种祭器就可晓得。假如世间根本并无神灵存在，人是不可能凭空制造出神灵的观念的。
试想，如果外界根本没有光，人能有青红皂白、风景图画的观念吗？如果外界根本没有声音，人能有琴瑟钟鼓、语言音乐的观念吗？
我们知道，凡是寄生在动物体内的寄生虫类，或生活在地下暗河中的水生动物，都一概没有视觉，或根本没有眼睛，因为它们的生活环境中没有光。由此可知，如果世界上没有光和声，人甚至将根本不会有眼睛和耳朵，更不必说有关光和声的观念了。
同理，如果根本没有神灵存在，人类怎么能够凭空产生神灵的观念呢？
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